巫妖大战中，蚩尤被太一以混沌钟杀死，却并未如其他巫族一般死后归于天地。这蚩尤是巫族的一个异数，早年曾误食过一株仙草，因而有了元神，令一众祖巫大惊，令蚩尤将仙草图形画出来后曾四处寻找，可惜终是再没有找到过，后来也就不了了之。蚩尤被太一杀死后，一点儿真灵飘飘荡荡来到地府，投入六道轮回盘中，生于九黎部落。
一日，蚩尤外出打猎，一路直入深山当中，却没有猎到任何动物，却不是因为他打猎不行，平时蚩尤仗着本领高强，所猎之物在族中最多，今日却一个猎物也没有看到，蚩尤大奇，不信邪，便往森林深处行去，誓要打到猎物。
正当行走之时，忽然前面一片开朗，只见一把黑色长刀插于土地当中，那刀杀气甚烈，方圆百丈之内寸草不生，蚩尤想这林中无鸟兽也必定是这把刀的杀气所致。
蚩尤正想靠近那刀，那刀忽然一阵黑光环绕于体，刀身一阵鸣动，拔地而起，直往蚩尤砍来，蚩尤不趁防备，慌忙躲过，却也被刀割破了手臂，鲜血溅于刀上，刀身一阵颤抖，由黑转成血红色，飞于蚩尤头顶转了三圈后，又直落于蚩尤面前。
蚩尤心道好险，好在此刀无意间被认主了，不然，小命今天就交代在这儿了。
蚩尤心念一动，那刀却是直接飞到了蚩尤手中，蚩尤手一接触那刀身，顿时感觉到一股冰寒气息直接由刀上向脑海内传去，脑袋内轰隆作响，片刻后，蚩尤却是将自己的前世今生全部记起。
原来这刀正是当初太一手中的戮妖刀，因还残留有太一的执念，所以一见着巫族中人便杀了过来，却不想被蚩尤无意间认主了，在戮妖刀的刺激下，蚩尤却是觉醒了血脉，记起了前尘往事。
记起了往年旧事，蚩尤便找到九凤，述说了发生在自己身上的经过，九凤也是大喜，这蚩尤血脉觉醒之后，修为暴涨，成就大巫之体，九凤以前也和蚩尤相识，此时巫族祖巫尽去，只剩几名大巫，现在多一名蚩尤，当然高兴不已，于是九凤就将九黎部落交给蚩尤管理，自己居于蚩尤之下。
蚩尤想要重振巫族当年风光，却又无甚好方法，如今人族占据天地主角，又有各教圣人相护，巫族祖巫皆亡，就是几教圣人对手，不能行那莽事，蚩尤苦思之下，终于想出一法。以九黎部落为基，统一人族，借人族气运重兴巫族，此乃人族内事，那些圣人也不好直接出手，这样在巫族现在所剩不多的几名大巫相助之下，一举夺得人皇之位，便能再兴巫族。
想到这些，蚩尤召开九凤，对她说了他的想法，九凤也是大喜，自是无有不应。蚩尤又召集族内修为较高的九九八十一名巫人，根据十二祖巫的十二天都煞神大阵，将八十一名巫人联合起来，一起练成了玄阴炼魂大阵。自己亲自手握蚩尤魔刀主持阵眼。蚩尤魔刀即是那戮妖刀，如今在蚩尤手中，自然要改过名来。九九寂灭大阵虽不如十二天都煞神大阵那般毁天灭地，但也是威力巨大，杀气冲天，配合起蚩尤魔刀施展开来，怕是一般准圣级别者也只有逃命的份。
轩辕在接替人族共主后，一系列惠民政策下来，人族发展更盛；而九黎部落在蚩尤觉醒后，走上了对外扩张的过程。轩辕想将人族政策向九黎部落普及，自己好成为真正意义上的人族共主；而蚩尤视轩辕人族为巫族发展大敌，巫族要再度称雄洪荒，则必须将轩辕人族打倒。轩辕部落与九黎部落在接壤之地就不可避免的发生了冲突，后来愈演愈烈，大战一触即发……
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